Bioinformatiker, vikariat

2025-11-17BioinformatikerNational Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS; https://nbis.se) är en stor och snabbt växande nationell infrastruktur som främjar forskning inom livsvetenskaperna i Sverige genom att tillhandahålla support, infrastruktur och avancerad utbildning inom bioinformatikområdet. NBIS utgör bioinformatikplattformen på SciLifeLab (https://www.scilifelab.se), en nationell resurs som tillhandahåller avancerade storskaliga tekniker och kunnande inom biovetenskaperna, och är också den svenska noden i den europeiska infrastrukturen ELIXIR för biologisk information.Nu ska en av våra bioinformatiker vara föräldraledig och vi söker därför, under en tidsbegränsad period, en vikarierande bioinformatiker inom vårt team för hälso- och kliniskt forskningsstöd. Teamet arbetar med alla aspekter av bioinformatiska analyser av främst humandata i medicinska och kliniska frågeställningar. De personer som anställs kommer att integreras i ett bioinformatikteam i en spännande forskningsmiljö med många möjligheter till utveckling av nya och existerande färdigheter för att hålla sig à jour med nya sekvenserings-teknologier och andra bioinformatiska utmaningar när de uppstår.ArbetsuppgifterVi letar efter en expert som primärt kommer att arbeta med bioinformatikanalys av humant transkriptomik- och genomikdata, men också med andra typer av bioinformatiska analyser. Arbetet innefattar att stödja svenska forskare inom detta område och projekten man deltar i kommer att skifta i komplexitet och längd och kommer med varierande medicinska och kliniska frågeställningar.Ansvarsområden inkluderar att planera, initiera, utföra och rapportera analyser samt kommunicera med forskargrupper samt hålla sig uppdaterad inom fältet och att ibland bidra till avancerad utbildning av svenska forskare inom bioinformatik. Regelbundna interna möten och internutbildning, samt tid för utveckling av egna färdigheter och lärande från en diversifierad grupp av NBIS-kollegor ger förutsättningar för NBIS-bioinformatikerna att utföra högklassiga bioinformatikanalyser.Arbetet kommer att innebära ett visst mått av resande, eftersom kunskapsutbyte är en viktig del av vår verksamhet för att bibehålla spetskompetens för analys av befintliga och nya datatyper.KvalifikationerFramgångsrika sökande behöver uppfylla följande krav:PhD inom något av följande områden: bioinformatik, molekylärmedicin eller ett närgränsande fält som arbetsgivaren bedömer relevant för tjänstenPostdoktoral erfarenhet av att arbeta med bioinformatikanalyser av omik-data.Mycket god erfarenhet av arbete (minst 10 år) med avancerade bioinformatikanalyser, inkluderande erfarenhet av analys (pre-processning och statistiska analyser, selektion och visualisering) av bulk- och singelcell-transkriptomikdata, spatiella proteomikdata (t.ex. Pixelgen), genetiska associationsstudier, samt Illumina och Nanopore helgenoms-, metylerings- och RNAseq-sekvenseringsdata.Dokumenterad erfarenhet av arbete (minst 5 år) med inflammatoriska och infektionssjukdomarErfarenhet (minst 5 år) av att, på internationellt konkurrenskraftig nivå, självständigt driva supportprojekt och utföra dataanalys relaterande till omik-dataErfarenhet av att arbeta i en nationell infrastruktur för bioinformatikstödGod förmåga i ett skriptspråk såsom R eller Python, att arbeta med bioinformatik-pipelines speciellt Nextflow, samt att arbeta effektivt i Linux kommandoradsmiljö och på storskaliga datorkluster.Mycket god förmåga att kommunicera på engelska, både i tal och skrift, samt kommunicera med forskare med olika bakgrunderMycket god erfarenhet att samarbeta och arbeta i en serviceintriktad organisationVilja att lära sig nya metoder och ha en förmåga att utveckla nya färdigheterHänsyn kommer också ges till god samarbetsförmåga, driv, självständighet och personlig mognad, samt hur bra sökandes erfarenhet och färdigheter kompletterar och stärker NBIS verksamhet.Önskvärt/meriterande i övrigtKunskapsöverföring är ett annat viktigt koncept för oss och handledarerfarenhet är starkt meriterande.Erfarenhet av arbete med autoimmuna sjukdomar är ytterligare meriterande.”Reproducerbar forskning” och ”FAIR data” är centrala koncept för oss och erfarenhet av relevanta verktyg och metoder är meriterande.AnsökanAnsökan ska innehålla CV med referenser och ett personligt brev med motivering till varför du är intresserad av anställningen och på vilket sätt anställningen matchar dina meriter.Om anställningen Anställningen är tidsbegränsad, vikariat 6 månader med möjlighet till eventuell förlängning. Omfattningen är heltid. Tillträde 2026-01-09 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: UppsalaUpplysningar om anställningen lämnas av: Bengt Sennblad, bengt.sennblad@icm.uu.seVälkommen med din ansökan senast den 1 december 2025, UFV-PA 2025/3550.Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitethttps://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.Fackliga företrädare: Saco-S - saco-s@uu.se, Seko - seko@uadm.uu.se, ST (OFR/S) - ofr@uu.sePlacering: Institutionen för cell- och molekylärbiologi Omfattning: Heltid Sysselsättningsgrad: 100 % Anställningsform: Tidsbegränsad anställning Lön: Individuell lönesättning Antal lediga befattningar: 1 Ort: Uppsala Facklig företrädare:Referensnummer: UFV-PA 2025/3550 Sista dag för ansökan: 1 december 2025 Sök jobbet