Bestzyme--生物信息高级科学家

该职位来源于猎聘 AI算法方向 工作职责： 1. 开发创新的机器学习和深度学习算法，用于蛋白质（酶）性能优化。 2. 设计生成模型（如变分自编码器、扩散模型、生成对抗网络等），应用于蛋白质（酶）序列设计与优化。 3. 构建高效的数据处理管道，处理蛋白质的序列和结构数据，包括从公开数据库或实验数据中提取特征。 4. 整合现有计算工具（如Rosetta、AlphaFold3）与AI模型，提升蛋白质设计的准确性和效率。 5. 与实验团队合作，通过实验数据不断改进模型性能。 6. 撰写高质量的技术文档和报告，推动算法在公司项目中的实际落地。 7. 跟踪AI、生物信息学及蛋白质设计领域的最新动态，为公司研发战略提供技术支持 任职资格： 1. 具备生物信息学/计算生物学/计算机/人工智能相关专业硕士研究生以上学历，博士优先； 2. 深入理解深度学习模型如Transformer、CNN、RNN、Diffusion等，并熟悉蛋白质（酶）序列和结构相关的生物学基础。 3. 有蛋白质（酶）设计相关算法开发经验者优先，如基于结构的序列优化或功能预测模型。 4. 编程能力：精通Python，熟练使用主流深度学习框架（如PyTorch、TensorFlow）。 5. 在顶会期刊或会议发表过与AI、蛋白质设计相关的研究成果者优先。 6. 具备分子动力学模拟或自由能计算经验（如GROMACS、AMBER），熟悉高性能计算（HPC）或分布式计算框架（如Slurm、Ray）者优先（加分项）。 7. 具有良好的团队合作意识和沟通表达能力，强烈的自我驱动和学习创新能力。 Binder设计方向 工作职责： 1. 设计和实现适用于Binder设计的AI模型（如扩散模型、Transformer、VAE等），提升Binder的亲和力与特异性。 2. 开发Binder自动化设计与筛选Pipeline，提高Binder设计效率和阳性率。 3. 整理和处理Binder设计相关的公开数据及内部实验数据，构建高质量训练集，设计数据增强策略，挖掘序列-结构-功能间的深层次联系。 4. 与实验科学家协作，协助Binder实验验证方案的设计，并基于结果优化Binder设计模型。 5. 跟踪蛋白质设计和生成模型领域的最新研究动态，将最新技术引入Binder设计工作流。 任职资格： 1. 具备生物信息学/计算生物学/计算机/人工智能相关专业硕士研究生以上学历，博士优先； 2. 熟悉主流Binder设计算法，或开发过Binder设计算法，有成功主导或参与Binder设计相关项目经验者优先。 3. 熟悉蛋白质-蛋白质相互作用原理，开发过蛋白质-蛋白质结合复合物预测或亲和力预测算法者优先。 4. 对Binder特性优化（如结合亲和力、动态特性调控等）有深入理解者优先。 5. 熟练使用主流深度学习框架（如PyTorch、TensorFlow），并有生成模型，如扩散模型、GAN、VAE等算法开发经验者优先。 6. 发表过与Binder设计、蛋白质工程或AI模型相关的高水平论文者优先。 7.有分子模拟经验（如GROMACS、AMBER）或自由能计算经验，熟悉高通量筛选技术及其数据分析方法者优先（加分项）。 8. 具有良好的团队合作意识和沟通表达能力，强烈的自我驱动和学习创新能力。 酶设计方向 工作职责： 1.结合深度学习（Transformer, GNN, Diffusion Model等）、强化学习（RLHF）、机器学习（XGboost、SVM等），设计并执行虚拟筛选，优化酶的活性、热稳定性、底物选择性等关键性能； 2.研究并应用蛋白质语言模型（ESM, ProtGPT, ProGen, ProtT5），进行蛋白质序列设计； 3.整合多模态数据（蛋白序列、结构、动力学、实验数据），提升AI模型的预测能力和泛化能力； 4.结合计算蛋白质设计工具（AlphaFold, Rosetta, MD模拟等），优化酶结构和性能； 5.与生物实验团队协作，分析实验数据，优化干湿闭环，提高模型预测效果； 任职资格： 1. 具备生物化学/生物信息学/计算生物学/计算机/人工智能相关专业硕士研究生以上学历，博士优先； 2.具备蛋白质序列-结构-功能建模相关经验，熟悉UniProt、PDB、Pfam等数据库； 3.熟悉蛋白质语言模型（ESM, ProtGPT, ProtT5）及其在酶优化中的应用； 4.熟悉计算蛋白质设计工具（Rosetta, GROMACS, AutoDock），能够结合实验优化酶性能； 5.有高通量筛选数据分析经验，能够结合机器学习优化酶改造流程； 6. 编程能力：精通Python，熟练使用主流深度学习框架（如PyTorch、TensorFlow）。 7. 在生物催化、合成生物学、AI等领域顶会期刊或会议发表过相关的研究成果者优先，有蛋白质语言模型、深度学习模型在酶设计中的应用经验者优先。 8. 具有良好的团队合作意识和沟通表达能力，强烈的自我驱动和学习创新能力。